Департамент може підпорядковуватися як керівнику так і його заступнику. Також можливе подвійне підпорядкування – керівнику та заступнику керівника одночасно.
Підпорядкування департаменту, як структурної одиниці, повинно визначатися у відповідному Положенні про Департамент організації праці та управління кадрів, яке регламентує його діяльність.
Положення про структурні підрозділи належать до обов’язкових локальних актів підприємства. Відповідні вимоги визначено в ч.2 ст. 64 Господарського кодексу України: функції, права та обов'язки структурних підрозділів підприємства визначаються положеннями про них, які затверджуються в порядку, визначеному статутом підприємства або іншими установчими документами.
Наприклад в Положенні першим пунктом можна зазначити: «Департамент організації праці та управління кадрів - є самостійним структурним підрозділом Підприємства. Департамент підпорядковується заступнику керівника (керівнику) Підприємства».
